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R语言数据分析及绘图专题学习会
来源:生物链   发布者:尹海华   日期:2017-04-10  

使用R语言软件的科研文献数量在近十五年来出现了飞速的上涨,包括生命科学、农业、遗传、环境、免疫、微生物、数学、神经科学、地球科学、天体科学、社会学、经济学、生态学、生物信息学等等众多科研学科。我们如今反复听说的大数据分析、数据挖掘、生物信息学分析及绘图、高通量测序数据分析等都首选使用到R语言来完成,因为R具有强大的数据分析统计和绘图功能。尽管R语言的历史不长,但以其开源、自由、免费等特点已经风靡全球,逐渐成为科学家的第二语言。目前R的使用者呈几何级数增加。R语言也逐步受到国内科研工作者,特别是青年学者和研究生的青睐。

尽管越来越多的科研工作者希望学习和使用R语言,但大多不知如何入手学习,更谈不上灵活应用。为了让科研工作者了解和使用R,莫速乎教育在2017421-23日在上海举办“R语言数据分析及绘图专题学习会”,目的在于让R的初学者尽快掌握R的用法并熟练应用到自己的研究当中。主讲老师将会在三天的时间内,通过多个生动的案例从入门到深入循序渐进的让您掌握R的统计、数据分析和绘图功能。无论您是R语言初学者还是有一定基础都将受益良多。

本次研讨会主办及承办单位:

莫速乎教育(上海莫速乎教育投资有限公司)

上海荆麦信息科技中心

会议目的:

让科研工作者从零基础了解R,并通过三整天的时间循序渐进逐渐深入的掌握R,并逐渐学会用R解决科研中的数据分析、统计及绘图问题。

主讲老师简介:

许教授,合肥工业大学教授、博士生导师,主持国家自然科学基金项目2项,承担了多个大数据项目研究工作,发表SCI/SSCI论文多篇,国内及国际多本杂志审稿人,已参编并出版多部统计及R软件相关书籍。在R语言方面具有很高的造诣。

课程安排:

课程将会从软件安装开始逐步深入并自带电脑同步练习。即使您没有任何基础也不必畏惧。课程将会以案例为主导,由浅入深的案例将您逐步带入R语言软件的天堂,学会用R语言解决常见的数据分析、统计及绘图问题。以下内容仅供参考,具体会根据现场学员的反馈情况适当调整。

时间

模块

授课题目

授课内容

421

模块1R语言基础

1.1 R语言概述

历史发展,社区情况,语言特点,成功案例。

1.2 R语言软件安装

安装R软件、R Studio软件,认识软件平台,阐述语言特点,创造R项目。

1.3 R语言包的安装

R包概念,R包安装,R包加载,R包查找,R函数(函数结构、经典的R函数)。

1.4 R语言功能与应用

大数据分析,图形处理,与其他软件接口,主要应用领域。

1.5 R语言资源和帮助文档

R主页,R社区,R在线帮助,R离线帮助。

模块2R语言基本操作

2.1 环境设置

工作路径(查找、更改),工作内存(查看、清理)。

2.2 对象操作

向量,矩阵,数组,数据框,列表,公式等。

2.3 数据结构与操作

定量数据(numeric or integer),定序数据(ordered, like integers),定类数据(categorical, nominal, or factor)。数据类型,数据显示,数据维度,数据查找(缺失值等),数据选取(子集),变量名称,样本名称等。

2.4 数据读取与保存

手动添加,数据导入(文件读取、数据库对接),互联网抓取。数据保存,数据导出。

模块3R语言函数编程

3.1 控制语句

条件与条件语句,循环以及嵌套语句,循环控制语句。

3.2 自定义函数

函数语法,函数结构,定义规则,参数类型(形参、实参、默认参数、返回值),变量作用域(全局变量与局部变量)。

3.3 编程与调试

脚本编写,函数加载,程序运行,程序调试。

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模块4R语言数据分析

4.1 R语言数据处理

数据加载,数据匹配,数据清洗,数据选取,数据抽样,数据转换,数据生成,数据补齐,频率转换。

4.2 R语言探索性分析

描述统计,分布特征,相关分析,关联规则,聚类分析,图形展示(直方图、箱线图、散点图、条件图)。

4.3 R语言随机模拟

随机数种子,随机数生成,Monte Carlo模拟,Bootstrap方法。

4.4 R语言统计分析

参数统计方法:统计推断(参数估计、假设检验),方差分析,回归分析,主成分分析,因子分析,聚类分析。非参数统计方法:核密度估计,卡方拟合优度检验,列联表分析,Wilcoxon符号秩检验,Mann-Whitney-Wilcoxon秩和检验,Spearman等级相关,Kruskal-Wallis方差分析。

423

4.5 R语言现代计算

数据挖掘:Logistic回归,K-means聚类,KNN分类,决策树,随机森林。

统计学习(机器学习):交叉验证,LASSO回归,神经网络,支持向量机,baggingBoosting

模块5R语言可视化

5.1 R语言绘图基础

绘图函数,绘图参数,图形控制,图形输出,经典图形制作。

5.2 R语言ggplot2绘图

ggplot2绘图理念,ggplot2包概述,高级绘图函数,低级绘图函数,交互式绘图函数,ggplot2编程,经典图形制作。

模块6:大数据案例分析——R语言应用

6.1 案例背景

案例介绍,数据来源,数据展示。

6.2 案例操作

研究目标,研究内容,模型算法,大数据集,数据分析,研究结果。

6.3 案例讨论


6.4 现场答疑


会议具体事项

研讨会时间地点

上海: 上海徐汇瑞峰酒店

上海市徐汇区肇嘉浜路7号(地铁9号线,打浦桥站3号口出十字交叉路口对面)

2017年4月21日~23日 (20日报到)

参会对象

各科研专业,需要发表SCI文章的科研工作者及硕士、博士研究生,年资不限。

注册费用

3200元/人,三人以上团体及老学员3000元/人

按缴费先后顺序确定座次;注册费含会场、专家讲课费、教材、午餐、税费。不含住宿费。

缴费账号

开户行:中国建设银行(上海市泗泾支行)
户名:上海荆麦信息科技中心
银行账号:3100 1983 0100 5002 2781

备注写明:姓名+R语言 以便于查询

少数单位转账时需提供我方开户银行行号:1052 9008 0036

如通过支付宝转账须支付到:(支付宝无法转账到企业银行,只能转账到企业支付宝)

企业支付宝:mosuhu@163.com

户名:上海莫速乎教育投资有限公司

缴费后请将汇款凭据截图或拍照,并发送邮件到yinhh@im.ac.cn告知详情以备核实。如多付款我们将会退还给您,敬请放心。经盖章的纸质版邀请函将会与发票一起在会议第二天下午统一发放给大家。目前可邮件索要经盖章的PDF版邀请函。

可以现场刷卡(公务卡、信用卡、储蓄卡等)或缴纳现金。

住宿 (不强行规定,可以自己预订住宿,费用自理。根据报道先后顺序安排合住,如需合住我们尽量协调,但如出现最后一个单人,自付整间房费。)

上海徐汇瑞峰酒店

地址:上海市徐汇区肇嘉浜路7号(地铁9号线,打浦桥站3号口出十字交叉路口对面)

标准间: 340/ 合住:170/ (含早餐、含宽带)

此价格为酒店提供我们的团体优惠价格,相当于携程等网上订购的380/间的房间

备注:住宿统一安排,费用自理,办理住宿时告诉前台是参加此学习班的即可,住宿费办理住宿时交给酒店前台。住宿费发票将在退房时由酒店开具给您。

报名咨询:

尹老师

电话:13717838339

邮箱: yinhh@im.ac.cn

其他须知:

1、会议报到:4月20日15:00-20:00在酒店一楼大厅报到领取教材,20:00之后到达酒店的请提前与何老师联系(18117251971)预留房间,当晚办理入住,第二天早上8:00会场报到。会议含统一午餐。

2、会议需自备电脑、鼠标。会场我们会布置充足的电源插座,请放心。主讲老师课上实际应用案例很多,学员需要一起操作练习,不会睡觉。

3、请确保电脑安装的是WINDOWS的操作系统(xp/vista/win7/win8/win10),而非苹果操作系统。

4、报到时候每人发放U盘一个,内有练习素材及软件,不必提前下载。

5、发票会在会议期间发放。

6、随发票一同发放的还有经过盖章的纸质版会议邀请函,以便于大家报销费用时作为会议凭证。如需要用来预支付费用,可以邮件索要经盖章的PDF版本的邀请函,您先将它打印出来拿去财务预支费用,均屡试不爽。

7、如果您针对统计方面有何疑问,请带着问题来,并可与授课老师当场交流。

8、我们使用了最高流明(亮度单位)的投影仪,并配合屏幕放大软件,您不必担心看不清屏幕。

会议报名方法

为了便于最快速的给您回复,请按下列格式自行撰写邮件发送到本次会议指定报名邮箱 : yinhh@im.ac.cn

(为避免进入垃圾箱,以下文字可能无法复制,请自行撰写邮件,包含以下内容即可,多谢谅解)

报名邮件内容模板:

我想报名参加4月上海的R语言数据分析及绘图专题学习会,以下是我的信息:

1、姓名:

2、性别:

3、单位:

4、邮箱:

5、手机:

6、发票抬头:如不确定,先留空。

7、是否预订住宿:如需预订住宿,是希望一人住还是与与人合住?一般默认住宿时间是从会议前一晚到会议最后一天中午退房。共3晚,如果有特殊需要请注明。

8、备注:备注说明写在此,比如有多人参加,请将姓名、性别、邮箱、手机在上面分别单独列出,备注中写明一位主要联系人。

关于报名的说明:

1、请务必留意会议主办单位为“莫速乎教育”及会议日期(4月21-23日)地点(上海),以免弄错;

2务请发到指定报名邮箱,而不要直接回复收到的通知邮件;

3、您发送后1天内会收到我们更详细的报到通知等说明,如2天后依然未收到请电话联系我们或核对邮箱再发送一次;

4、如有任何疑问,也可直接拨打会务组尹老师:13717838339


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