WES对治疗方案也有重要的临床意义,如6/23例(26%)改变了治疗方案,1/23例患儿停止了原本计划的检查,另1例患儿父母进行了产前植入前的基因诊断。治疗方案的变化包括并发症的监测,在确诊其他诊断时停止对可疑诊断的随访,以及对已知或正在发生的并发症进行专家评估。
该研究提示标准诊断流程的费用很高,早期应用WES可使成本效益最大化。对于具有复杂神经系统疾病的患儿,前期基因检测的费用占总费用的43%,即使没有前期基因检测的高费用,早期应用WES仍能使每个病人节约花费9020澳元,首次遗传学评估时查WES也比不查全外的标准诊断流程节省5461澳元。但课题组对费用的估算仍比较保守,因为不包括社区卫生人员进行的诊断检查费用。
使用家系WES可能提高阳性率,但其性价比仍有待确定,一项对17名先天性智力残疾儿童的回顾性研究发现,家系WES代替其他的基因检测和代谢筛查,可以节省大量的费用,但对其他临床表型的患儿,家系WES的经济效益仍有待进一步验证,同样,对于全基因组测序的临床价值和经济效益也需要进行类似的研究。
虽然该研究发现早期采用WES对有相关表型患儿的临床价值和性价比最高,但WES仍不能取代传统的辅助检查,且该试验的研究对象比较局限,所以在临床中仍应根据患儿不同的临床表现,制定个体化的遗传学检测策略。