巴基斯坦一项遗传研究揭示人类生存可不需要 1300 个基因。图片来源:Babar Shah
当科学家想要弄清楚一个特定的基因在小鼠中起什么作用时,他们会将其敲除。这种方法不能用于人体,但一些人天生没有一些基因——出生时缺失一个或更多基因。现在,一项对 1.05 万名巴基斯坦人的 DNA 进行的研究发现,超过 1300 个基因在缺失后没有导致明显的健康问题。这些结果或有助确定为什么一种新型心脏病药物未能在临床中发挥作用,以及为什么另一种新药正好起作用。
这项研究是若干寻找健康人明显基因缺失的最新成果,这些项目包括在冰岛和英国的相关研究。“人类基因组工程为我们提供了 1.8 万个基因的一部分目录,这个工程正在尝试了解失去一部分基因会造成什么样的生物学结果。”美国马萨诸塞州博大研究院心脏病遗传学家、该研究领衔作者 Sekar Kathiresan 说。
在巴基斯坦,人们经常会与他们的第一个表亲结婚。这提高了母亲和父亲双方将一个特定基因突变的类似副本传递给后代的几率(除非这个变异基因位于一个性别染色体上,父母双方的一个基因副本都被完全敲除)。Kathiresan 的团队检测了 10503 名参与长期心脏病和糖尿病研究的巴基斯坦人的 DNA,发现其中有 1317 个完全缺失的基因。该团队之后在大约 200 个临床血液生物标记如胆固醇中寻找了异常。
有 7 个基因在至少两人中失去作用,它们明显与一些生物标记变化相匹配,比如罕见的低胰岛素水平,该团队近日在《自然》报告了这一研究成果。其中一个叫作 Lp-PLA2 的酶与动脉斑块有关。因为更高水平的 Lp-PLA2 与更多的心脏病有关,药物公司已经在 Lp-PLA2- 阻断药物方面花费了数十亿美元。但缺乏一种或两种该基因副本的巴基斯坦人却并未降低心脏病风险,这解释了为什么这些药物未能在临床上起作用的其他原因。
在另一方面,该研究发现对于另一种心脏病靶向药物则可大力支持,这是一种可限制机体代谢甘油三脂能力的叫作 ApoC-III 的蛋白。Kathiresan 的团队研究了失去一个 APCO3 基因复本的人。“过去 4 年,我们一直在寻找完全失去这个基因的人。”他们并未在美国和欧洲发现一例,但在巴基斯坦,该团队发现了一个家庭包括父母双方和 9 个孩子都缺乏 APCO3 基因。
当这个家庭的成员服用高脂肪奶昔后,他们的血糖水平明显上升,表明他们的身体中几乎没有阻塞动脉的脂肪,这应该能够防止心脏病发生。这个家庭似乎非常健康,Kathiresan 推测,现在临床中测试的 ApoC-III- 阻断药物应该是安全的。这种药物最终将加入另一种预防心脏病药物,它来自于对缺失一种叫作 PCSK9 的基因的一名健康女性的研究。
英国伦敦玛丽女王大学人类遗传学家 David Van Heel 说,这项巴基斯坦研究是研究人员首次验证他们发现的一些基因缺失,以了解其对人们健康的影响。Heel 去年发表了一项英国—巴基斯坦人基因缺失的小规模研究。因为个体样本非常稀少,“我们的确应该继续对更多人测序”。他说。Kathiresan 的团队估计,可能在 20 万名巴基斯坦人中足以找到约 8700 个基因缺失(其中一些基因对于早期发育非常重要,然而这样的人却不存在)。
Kathiresan 和其他人正在呼吁人类工程项目对所有这些工程的数据和其他单个数据库中的大规模群体遗传研究进行分析。该研究共同作者、博大研究院的 Daniel MacArthur 很快将公布一批原型,包括来自 ExAC 人类大规模基因组的缺失基因。该计划旨在让研究人员和药物企业能够联系到研究的原作者,如此他们可以找到数据库中某个缺失基因的个人,从而让这个人在临床上进行更多验证。
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