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“生物信息学暨表观遗传学与数据分析”高级实操班培训
作者:   来源:生物链   发布者:尹海华   日期:2017-04-24   今日/总浏览:1/1251

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各有关单位:

表观遗传学是研究基因在核苷酸序列不发生改变的情况下,基因表达可遗传变化的一门遗传学分支学科。目前,已知的表观遗传现象有DNA甲基化基因组印记母体效基因沉默RNA编辑等。DNA(主要是CpG的)甲基化是其遗传机制和表型效应最为明确的表观遗传性机制。表观遗传学的研究已成为基因组测序后的人类基因组重大研究方向之一。这一飞速发展的科学领域从分子水平揭示了复杂的生物学现象,为解开人类和其他生物的生命奥秘、造福人类健康带来了新希望。为了提高从业人员的技术水平,应广大行业工作者的要求,中国生物工程学会和中国科学院微生物研究所网络信息中心联合举办“生物信息最新技术--DNA甲基化与表观遗传数据分析,由北京中科润开生物科技有限公司具体承办。培训班采用理论和演示相结合的教学形式,同时学员与授课专家进行现场交流与咨询,探讨学员在平时工作、研究中的瓶颈问题。与同行交流以拓宽自己的研究思路,共同探讨和挖掘表观遗传学资源的科学研究价值和应用前景。

一、培训特色

主题明确,针对性强,理论和实践结合,主讲与学员研讨的方式进行

讲师拥有丰富的微生物数据分析和项目执行经验

课下主讲老师为您所遇到的问题提供个性化解答

配合研究中所需的要点,围绕实际研究中常用的软件展开;

学员通过与专家直接交流,能够分享到顶尖学术机构的研究经验和实验设计思路。

二、培训对象

大中专院校生物信息、生物计算、生命科学、医学、化学、农学、计算机科学对生物信息有一定了解的

在校教师,研究生、博士生及科研单位从事该领域的研究人员

三、时间地点

2017年5月19日——5月23日

中国科学院微生物研究所

(时间安排:第1天报到,授课4天)

四、培训内容

一、表观遗传学研究现状及未来发展

二、表观遗传学相关的数据库介绍与使用

三、高通量测序技术概述

四、常用生物数据文件类型介绍与格式转换

五、代测序数据质控、比对分析与可视化

六、常用在线工具和数据库使用操作

一、DNA甲基化原理、应用及研究方法、微生物基因组

1甲基化特异性的PCR(Methylation-specific PCR,MSP)

2亚硫酸氢盐测序法(Bisulfite sequencing PCR,BSP)

3 高分辨率熔解曲线法(High Resolution Melting,HRM)

4.比较各项甲基化研究方法存在的优缺点等

二、DNA甲基化数据分析策略

1 WGBS分析:利用fastqc和perl脚本对原始数据进行质控

2 之后用bismark进行mapping和beta值计算

3 R的methylKit包筛选差异甲基化位点并用pheatmap包和ggplot2包进行可视化

4.PeakAnnotator对 这些位点进行功能域和基因注释,最后用DAVID进行GO和 KEGG 通路注释

DNA甲基化调控案例讲解

DNA甲基化测序数据分析上机实战

三、DNA甲基化芯片数据分析上机实战

1芯片DNA甲基化分析

2利用R的IMA包进行差异甲基化位点鉴定并用pheatmap包和ggplot2包进行可 视化, 用DAVID进行GO和KEGG通路注释

一、染色质可及性测序技术

二、组蛋白修饰原理与分子功能

三、组蛋白修饰功能

四、核小体定位图谱分析实战练习

五、组蛋白修饰数据分析实战练习一

六、组蛋白修饰数据分析实战练习二

一、还原真实染色,质构象--HiC技术

二、TCGA与ICGC,数据库介绍与使用

三、干细胞的表观遗传学研究

四、转录因子ChIP-seq数据分析

五、生存曲线分析


五、主讲专家

主讲专家来自中科院等科研机构的高级专家,拥有丰富的科研及工程技术经验,长期从事生物信息领域项目研究,具有资深的技术底蕴和专业背景。

六、颁发证书:

学员经培训考试合格后可以获得:

由中国生物工程学会颁发的《生物信息工程师》培训证书。

注:请学员带两寸彩照2张(背面注明姓名)、身份证复印件一张。

七、报名办法及费用

每人¥4500元(含报名费、资料费、培训费、考试费、证书费),食宿可统一安排,费用自理。请各有关部门统一组织本地区行政、企事业单位报名参加培训,各单位也可直接报名参加,报名回执表请邮件发送至会务处。

八、联系方式:

联系电话:010-56234740

报名邮箱: zky_im@163.com

监督电话:010-64807385-8012

中国生物工程学会 北京中科润开生物科技有限公司

二零一七年四月二十日

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