AACR：“GENIE”呼之欲出，志在共享癌症基因组临床数据

来源：生物探索   发布者：张荐辕   日期：2015-11-18  

11月6日，Genomeweb报道，美国癌症研究协会（AACR）推出了一项叫做“GENIE”的国际基因组和临床数据共享项目，旨在将不同癌症中心的基因组和结果数据汇总起来。 该项目中的“GENIE”寓意Genomics（基因组学）、Evidence（证据）、Neoplasia（肿瘤）Information（信息）Exchange（交换），是这5个单词的首字母缩写。 “GENIE”项目的启动阶段由来自美国，加拿大和欧洲的七个创始成员和两个信息合作伙伴参与，共享他们拥有的肿瘤患者临床测序数据。 这个联盟的创始成员包括： 荷兰乌德勒支个性化癌症治疗中心（the Center for Personalized Cancer Treatment in Utrecht, the Netherlands）；波士顿Dana-Farber癌症研究所（Dana-Farber Cancer Institute in Boston）；法国维勒瑞夫Gustave Roussy研究所（Institut Gustave Roussy in Villejuif, France）；巴尔的摩约翰霍普金斯大学的Sidney Kimmel综合癌症研究中心（Johns Hopkins University's Sidney Kimmel Comprehensive Cancer Center in Baltimore）；纽约纪念斯隆-凯特琳癌症中心（Memorial Sloan Kettering Cancer Center in New York）；加拿大多伦多玛格丽特公主癌症中心（Princess Margaret Cancer Centre in Toronto）以及田纳西州纳什维尔Vanderbilt-Ingram癌症中心（Vanderbilt-Ingram Cancer Center in Nashville, Tennessee）；信息合作伙伴是位于西雅图的Sage Bionetworks和纽约的cBioPortal。 AACR的“GENIE”项目欲将上述参与该计划机构已经建立CLIA和ISO标准验证的测序数据收集到一起，并给予一个单独的注册号，并将其与经过长期追踪的临床试验结果进行关联，使得访问者在输入一个清晰的标签关键词后，能够打开这些数据的访问，并查阅到公开的相关数据。 长期追踪的数据库中目前已经包含了超过17000个基因记录，且这些基因在癌症晚期将会变得愈来愈丰富，因此可作为临床决策的依据。随着时间的延伸和参与研究机构的增加，记录的增多使得该项目逐渐迈入试点研究阶段。 Gustave Roussy 研究所的Fabrice André教授作为AACR的“GENIE”项目的指导委员会成员，他表示，数据共享项目是至关重要的，这能够将数据产生处，医院的主要医生，试剂厂商和生物学家分析的数据链接在一起。 “GENIE”项目希望能够帮助验证具有基因标记的药物对受试者的反应及预后特征，识别FDA新批准药物的可用患者群体，并扩大现有药物能够作用的患者群体，以及进一步确定新的药物靶点（drug targets）和生物标记物（biomarkers）。

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