Nature、Science：别让问题试剂毁了你的研究

来源：生物通   发布者：亦云   日期：2015-07-23  

高质量的化学试剂在生物学研究中起到了至关重要的作用。一群顶尖科学家日前在Nature Chemical Biology杂志上发表文章指出，许多研究者正在无意中使用低劣的化学试剂，结果得出了错误的研究结论。这不仅是人力、物力和财力的极大浪费，还严重耽误了新药的开发。 “糟糕的试剂产生糟糕的科学，这不仅是金钱上的浪费，还糟蹋了我们的事业，”结构基因组联盟的生物化学家Aled Edwards说。尽管有不少文献报告过出现问题的化学试剂，但这些试剂仍在被不少人使用。“现有做法无法解决这样的问题，我们在这方面的信息交流出现了系统性故障。” 科学家们为此建立了一个Chemical Probes Portal网站，希望帮助研究者们选择质量更好的研究工具，避免研究出现意想不到的错误。Nature、Science纷纷对这一新鲜事物进行了报道。 化学探针是可以特异性结合并有效调节目标活性的小分子。高质量化学探针在生物学研究中是很有价值的，在分子生物学和遗传学领域得到了广泛的应用。化学探针有助于在分子水平上准确理解目标分子及其相关通路，人们用化学探针来抑制（或者激活）特定蛋白，以确定这些蛋白在细胞或机体中承担的功能。此外，化学探针还是强大的药理学工具，将基础研究和转化医学连接起来。研究者可以通过化学探针做出决定，是否进入时间长而且成本高的药物开发。 文章指出，正确的化学工具能使人们获得新的生物学知识，有助于把新发现转化为新药物，并最终用于临床治疗。但劣质的化学探针会造成非常严重的问题，误导研究者们得出错误的结论。举例来说，一些探针会产生副作用，使蛋白发生化学改变，或者导致蛋白聚集而危害细胞。还有一些探针能与目标以外的蛋白结合，产生很大的脱靶效应。这些探针会影响细胞中的大量蛋白，对于生物医学研究来说根本是没有用的。 研究者们在寻找新探针的时候，往往是去查找文献，而且倾向于使用引用次数最多的探针。但这些探针往往比较老，并且性能并不可靠。文章指出，传统搜索引擎并不能有效帮助研究者找到最好用的研究工具。Chemical Probes Portal是一个可以分享心得体验的平台，研究者们可以从中获得化学探针的最新信息，根据其他人的实际经验选择最适合自己的探针。 这篇文章列出了一些劣质或过时的化学探针，其中就包括LY294002。LY294002已经问世二十年了，被用来选择性抑制癌症中的一类重要蛋白（PI3激酶）。2004年以来，越来越多的证据表明LY294002存在不容忽视的脱靶问题。LY294002虽然被大量引用，“但它其实是个糟糕的探针，已经过时十年了而且脱靶效应大，” 文章的共同作者，英国癌症研究中心的负责人Paul Workman教授指出。实际上更精确的探针已经面世好多年了，但还有商家将LY294002作为PI3激酶抑制剂售卖，不少研究者们仍在使用它。 文章还指出，对化学探针的错误认识，导致每年有数以千计的研究论文得出不准确甚至错误的结论。几年前，劣质探针生成的数据让一个III期临床试验遭遇滑铁卢。研究人员对候选癌症药物iniparib进行了多年研究，花费了大量的时间和金钱，共有五百多名患者接受了药物治疗。然而这种药物并没有起到预期的作用，于2011年彻底失败。 科学家们认为，Chemical Probes Portal不仅能为研究者们提供宝贵的信息，也应当被学术期刊的编辑和审稿人重视起来。另外，化学试剂的供应商也应当为其客户提供更详细更准确的信息。 “化学探针对于生物医学研究和药物研发来说是至关重要的，但许多我们正在使用的许多探针实际上名不副实。这个普遍存在的现象，正在暗暗破坏科学研究的质量，产生误导性结果，浪费人们的时间和金钱，阻碍新癌症药物的问世。这是一个迫切需要解决的问题，我们希望能够这个网站提供的探针使用信息，能够在这方面有所帮助，”Workman教授指出。 “我们这个网站可以为研究者们提供最新、最可靠的信息，帮助他们在研究中选择和使用最好的探针，造福整个科研群体。药物研发和临床试验必须建立在坚实的基础之上，”英国癌症研究所的Julian Blagg说。

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